Phosphoproteomics to Characterize Host Response During Influenza A Virus Infection of Human Macrophages
Sandra Soderholm, Denis E. Kainov, Tiina Ohman, Oxana V. Denisova, Bert Schepens, Evgeny Kulesskiy, Susumu Y. Imanishi, Garry Corthals, Petteri Hintsanen, Tero Aittokallio, Xavier Saelens, Sampsa Matikainen and Tuula A. Nyman
Molecular & Cellular Proteomics (2016), 15, 3203-3219
季节性传播的流感A病毒正在开始感染越来越多的人。为了深入了解这种突变非常快的病毒及其躲避我们抗病毒治疗手段的方式,作者研究了所有暴露在病毒下宿主细胞因子。
作者用流感病毒感染了原代人巨噬细胞后研究了其信号通路和主要的细胞因子变化。采用了LC/MS/MS技术和生物信息学分析,他们发现了1113个人类磷酸化蛋白在感染IAV后发生变化,表明流感病毒会显著影响宿主细胞的磷酸化水平。其中有222个差异蛋白的285个磷酸化位点从未被报道过。
差异表达蛋白中有很大一部分细胞周期以来的激酶底物。作者检测了一系列的CDK激酶抑制剂,并发现了一种潜在的IAV相关细胞毒性抑制剂。该化合物进一步在小鼠感染病毒的实验中被发现能够使其10天致死率从83%降到0. |