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我们很高兴地宣布Mascot Server 2.6正式发布了! 这一版本最重要的新功能是谱图库的搜索整合,其它的更新和改进请参考Mascot 2.6 release里的详细介绍。

如果您的Mascot Server处于免费升级的期限内,那么您很快就会收到一封包含下载链接和新产品密钥的电子邮件。如果您的免费升级期限已过,欢迎 联系我们 获取版本升级操作的详细信息及费用。

这个月的特色文献中阐述了HSP分子伴侣蛋白复合物的网络以及该网络是怎样被破坏掉的,进而寻找潜在的癌症疗法。如果您最近也有文章发表并且希望我们列举在下一期的新闻稿中,请给我们 相关的PDF或URL.

本月的Mascot小技巧是如何在Windows系统中向Mascot Server提交非常大量的搜索任务。

如果您有任何意见或问题,请随时 联系我们.

 

2016.12

谱图库检索
特色文章
本月Mascot小技巧
 

新品:Mascot 2.6谱图库检索

在Mascot Server 2.6中,您可以搜索任意组合的氨基酸Fasta文件、核酸Fasta文件以及谱图库文件。所用的谱图库搜索引擎是 NIST MSPepSearch.

搜索完成后,您可以根据蛋白质家族的独有特征来查看和查询结果。 这为将相关蛋白分类到蛋白家族中提供了优势。

在数据库管理器中,谱图库的处理将与Fasta文件结合起来同步进行。您只需点击几下鼠标,就可以自动下载、配置和更新许多公共库。借助灵活的数据导入过滤器,您还可以设计自动创建基于Mascot搜库结果的谱图库。

Mascot Server 2.6和Mascot Daemon 2.6的新特性介绍详见 网站.

spectral library

使用Mascot的特色文章介绍

在这里我们重点介绍了一篇近期发表的有趣并且重要的文章,它用Mascot进行蛋白质鉴定,定量或表征。如果您想要您的文章也在这里重点推荐,请发给我们 一个PDF或URL.

 

The epichaperome is an integrated chaperome network that facilitates tumour survival

Anna Rodina, Tai Wang, Pengrong Yan, Erica DaGama Gomes, Mark P. S. Dunphy, Nagavarakishore Pillarsetty, John Koren, John F. Gerecitano, Tony Taldone, Hongliang Zong, Eloisi Caldas-Lopes, Mary Alpaugh, Adriana Corben, Matthew Riolo, Brad Beattie, Christina Pressl, Radu I. Peter, Chao Xu, Robert Trondl, Hardik J. Patel, Fumiko Shimizu, Alexander Bolaender, Chenghua Yang, Palak Panchal, Mohammad F. Farooq, Sarah Kishinevsky, Shanu Modi, Oscar Lin, Feixia Chu, Sujata Patil, Hediye Erdjument-Bromage, Pat Zanzonico, Clifford Hudis, Lorenz Studer, Gail J. Roboz, Ethel Cesarman, Leandro Cerchietti, Ross Levine, Ari Melnick, Steven M. Larson, Jason S. Lewis, Monica L. Guzman & Gabriela Chiosis

Nature 538, 397-401 (20 October 2016)

作者研究了以HSP70和HSP90这两个分子伴侣为中心的多蛋白复合物,发现它们是涵盖诸多细胞过程的更大网络的一部分,对于维持肿瘤细胞功能至关重要。作者将这一更大的网络称为epichaperome。

作者还发现某些癌细胞中的这一网络是活跃的,可以一定程度地保护这些细胞。然而,破坏这些分子伴侣复合物就会引起网络的解体,进而致使细胞死亡。他们研究了多种癌细胞(胰腺癌、胃癌、肺癌、乳腺癌,以及淋巴瘤和白血病),发现大约有60-70%的细胞中都含有中等水平甚至高水平的epichaperome复合物。此外,癌基因MYC能够触发这一网络的重构以及驱动epichaperone的形成。该网络相对较易被破坏,这或许可以为药物干预提供机会。

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本月Mascot应用小技巧

在二月份的通讯稿中,我们介绍了如何用命令行提交搜索以避免IIS(Microsoft Windows附带的Web服务器)的4 GB上传限制。

现在,Mascot Server 2.6给出了一个更好的解决方案。Mascot Daemon 2.6 在Mascot服务器上运行时,会绕过Web服务器直接向Mascot提交搜索。这就解决了文件大小限制和搜索超时的问题。

Mascot Daemon 2.6还提供了更加完善的状态信息功能,包括任务完成百分比的提示,以及一个可用于取消正在进行的搜索任务的按钮。 您还可以在 网站 查看有关Mascot Daemon 2.6其他新功能的详细介绍,若您需要中文版详细更新介绍请联系康昱盛。

Mascot Daemon

关于 Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具,帮助他们更快速,更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系康昱盛以获取更多的信息。

 

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