欢迎

为了庆祝Matrix Science成立二十周年，我们决定推出一项特惠活动：所有Mascot Server升级均可享受8折优惠。

我们计划在6月4日和5日在圣地亚哥举办的ASMS会议上，主持两场早餐研讨会，诚挚邀请您的参与。

我们也很高兴地宣布Mascot Distiller 2.7的发布，它在处理大多数profile数据方面速度得到了提升。我们在这里介绍了一个Distiller对于MS3报告离子定量方法的工作流程。

本月的特色文章中详细介绍了一个简单的通过蛋白酶N端鉴定酶底物的方法。如果您最近也有文章发表并且希望我们列举在下一期的Newsletter中，请发给我们 相关的PDF 或者URL。

如果您有任何意见或问题，请随时联系我们。

20周年特惠

今年是Matrix Science公司成立20周年的纪念。为了庆祝，我们对所有Mascot Server的升级费用提供8折优惠。这个优惠活动的报价适用于2018年7月31日之前提交的升级订单。

在最近的版本中增加了许多重要的新特性，例如2.3版本中的加入了Percolator支持，2.4版本中的数据库管理器，2.5中提供对64位Mascot Daemon，并且在2.6版本中的整合了谱图库搜索的功能。

如果你已经有了Mascot Server的licence，但是低于现在发行的版本（2.6），可以向我们的销售系统邮箱sales@matrixscience.com 发送email进行询价，我们会自动给您折后价格，点击这里，阅读详情。

Matrix Science在ASMS的早餐研讨会

在加州圣地亚哥举办的即将到来的ASMS会议上，请您前来参加我们每年举办的用户会。这些早餐会将于6月4日和5日在圣地亚哥会议中心举行，我们将在那里介绍数据库搜索的最新工具和技术。我们还有两位专题演讲人将介绍他们振奋人心的应用。

6月4 日，星期一，7:00 am - 8:00 am

拓展人类蛋白质组磷酸化研究的前景
报告人：Claire Eyers 利物浦大学蛋白质组研究中心

Mascot Distiller全面提速
报告人：Matrix Science

6月5日，星期二，7:00 am - 8:00 am

含碘烷基化试剂对鉴定的人为影响，以及在蛋白质组样品中多聚物污染
报告人：Dominic Winter 波恩大学生物化学和分子生物学研究所

利用谱图库提取一组多肽
报告人：Matrix Science

点击此处报名注册，请预定座位，名额有限，提供早餐。

使用Mascot Distiller对MS3报告离子进行定量分析

当我们使用报告离子（例如iTRAQ或者TMT）定量方法时，报告离子区域的干扰类型会使得结果有一定的倾向性。许多研究者在MS/MS谱中进一步选择碎裂一个主峰，并利用MS3谱图中的报告离子进行定量，这些离子则基本上不受干扰。

Mascot Distiller支持这个工作流程。MS3的报告离子被拼接到MS/MS谱图中，并取代MS2的报告离子。这要比简单的成对地加和MS3和MS2的谱图更好。

我们用一个已发表的TMT-6标的数据集演示了这一点。仅使用MS3的报告离子给出的多肽比值是2.99（与预期的值3.0相比），把整个谱图相加得到的值是2.70. 仅通过MS2进行定量得到的值是1.99.

点击这里，阅读详情。

使用Mascot发表的优秀文章

在这里，我们列举了一篇近期发表的有趣并且很重要的文章，该文章运用Mascot 进行了蛋白质鉴定、定量及特性分析，如果您想要您的文章也在这里重点推荐，请发给我们 一个PDF或URL。

Simple, scalable, and ultrasensitive tip-based identification of protease substrates

Gerta Shema, Minh T. N. Nguyen, Fiorella A. Solari, Stefan Loroch, A. Saskia Venne, Laxmikanth Kollipara, Albert Sickmann, Steven H. L. Verhelst and Rene P. Zahedi

Molecular & Cellular Proteomics, (2018) 17 826-834

本文提出了一种新的鉴定在不同蛋白质底物上蛋白酶作用形成的新的N-末端的方法。揭示了有关调控蛋白质分解网络在健康和疾病方面的信息。该方法基于N端肽段富集，接下来用质谱进行定性及定量。

这个方法，在吸管尖或ChaFRAtip基于电荷的分级对角线色谱法，是利用大家熟知的蛋白质化学并进行最小化的设备：一个带有纤维素的吸头，强阳离子交换珠和常见缓冲液。与iTRAQ-8标试剂配合，这个方法可以对8组样品超过2000个N末端肽段进行定量，每个条件/通道使用4μg蛋白。

作者将原来的LC/MS方法与通过十字孢碱诱导sh-SY5Y细胞凋亡的ChaFRAtip方法进行了比较。他们得到了两种方法相似的技术重现性，在1%FDR的条件下定量了975±24(HPLC)和783±71(Tips) 条unique的 N末端肽。

Mascot Distiller 2.7

我们很高兴宣布Mascot Distiller 2.7版本的发布。其中最重要的改变是，如果数据点的质量值不代表连续的线性质量尺度，则不再需要“re-grid”谱图。这使得对于压缩的profile数据，当基线数据点已经不再被使用，其谱峰提取速度将大大提高，并可通过指定过粗的质量尺度来避免使谱峰变形的可能性。

你可以从技术支持页面下载Mascot Distiller。如果你正在使用早期的版本，记住Mascot Distiller的升级时免费的！如果你希望评估Mascot Distiller，发送email到 support@matrixscience.com申请试用序列号，你可以在线注册申请获得一个30天的试用licence。如果没有注册或者超过试用期，Mascot Distiller 在浏览模式下运行。

关于 Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助他们更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系康昱盛以获取更多的信息。

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