Mascot 小贴士
在网页版本Protein Family Summary报告中的报告生成器(Report Builder)是一种功能强大的创建用户自定义蛋白列表的方法。您可以选择包含哪些列及其排序方式,过滤掉不感兴趣的蛋白质,例如one-hit wonder(只有一条肽匹配的蛋白),并可以导出csv格式的表格,直接用excel打开。
要查看Report Builder是如何工作的,请单击此链接加载典型的报告示例,展开Sensitivity and FDR部分,并将FDR设置为1%的peptide sequence(而不是PSM)。结果报告重新加载后,切换到Report Builder选项卡。
通过展开Filters部分,并且选择Num. of significant unique sequences > 1,点击filter,来过滤掉one-hit wonder的结果。你现在可以得到268个高可信度的蛋白列表。
若要对列进行选择和重新排序,请展开Column部分。使用"Arrangement"下拉列表加载已保存的排列,或在本练习中选择"custom"来配置新的列表设计。
在"Enable"中,选择emPAI和Description,并将它们移动到"Available"。在"Available"下,为每个比率选择比值和多肽数目,并将所有14个项目移动到"Enable"。(若要同时选择多个项目,请按住ctrl并单击单个项目或通过按住shift并单击选择某个范围)。
很可能新选择的那些条目会出现在Enable列表的顶部。为了将它们移到列表的末端(将会出现在结果表格的右侧),选择所有要移动的项目,请使用列表下面的向下箭头。最后,选择Apply。
你可以通过点击任意一列的顶部一栏,来进行排序。如果这是您本地的Mascot Server,并且您认为这个列表的安排将来可能有用,可以通过再次展开Column部分,输入合适的名称并选择保存来保存它。保存表头排列的前提是,你在登录Mascot security后进行个性化设置,如同这里所说的,也能对全局进行设置。
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