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欢迎来到第103期

我们很高兴在休斯顿举行的ASMS早餐会议上见到许多用户。如果你没能参加我们的年度用户会议,可以在下面找到幻灯片和演讲者的笔记。

我们精选了一些在ASMS上突出Mascot广泛应用的特色海报。如果您在ASMS上展示了使用Mascot完成的相关工作,并且希望列举在下一期的Newsletter中,请将相关的PDF文档或URL链接发给我们

Mascot本月小贴士更新了我们的培训资料,供大家参考。

如果您有任何意见或问题,请随时联系我们

 

2023.06,103期

用户会议
Mascot在ASMS
培训资料
关于Matrix Science
 

Mascot: 深受客户信赖25年的蛋白质质谱鉴定标准参考软件

2023 ASMS Mascot 用户会

用户会议上两场演讲的幻灯片和演讲者笔记现在已经可以下载了(点击下方标题链接即可)。第一个演讲介绍了单细胞蛋白质组学的研究方法,并提供了Mascot Server 和Mascot Distiller的推荐参数。第二场报告介绍了Matrix Science成立25年来的企业历程。

Single cell proteomics with Mascot (PDF)
Patrick Emery, Matrix Science

  • SCoPE-MS spectra are similar to bulk sample spectra, and standard settings work fine
  • Single-cell spectra are quite different to bulk spectra, with lower signal to noise
  • Mascot gets good results with the right peak picking; we also recommend enabling Percolator rescoring

25 years of Matrix Science (PDF)
Ville Koskinen, Matrix Science

  • 1998: Matrix Science Ltd founded by John Cottrell and David Creasy
  • Mascot Server 1.0 released 1999, and free service launched
  • 2019: 25 millionth free online Mascot search

演讲文稿也可在我们的网站上下载。

Illustration for ASMS

ASMS上的Mascot海报

以下是在2023年ASMS大会上展出的五张精选海报,分别展示了Mascot在各种领域的应用。如果您在ASMS上展示了使用Mascot完成的相关工作,并且希望列举在下一期的Newsletter中,请将相关的PDF文档或URL链接发给我们

 

TP 370: The Challenge of Plant Identification in Complex Mixtures: Closely Related Families, Large Proteomes, and Unsequenced Genomes (PDF abstract)

Melinda A. McFarland1; Sara M. Handy1; Elizabeth Hunter1; Christine H. Parker1; Ann M. Knolhoff1

1FDA-CFSAN, College Park, MD

MP 009: Collagen Remains in Palaeotherium Bone from the Isle of Wight (UK) (PDF abstract)

Joseph Hubbard1; Steven Robinson2; Ardern Hulme-Beaman3; Martin Munt4; Krzysztof Pawlak2; Steve Taylor1

1Department of Electrical Engineering & Electronics, University of Liverpool; 2Materials Innovation Factory, University of Liverpool; 3University of Liverpool, Liverpool, United Kingdom; 4Dinosaur Isle Museum, Sandown, United Kingdom

MP 600: Inside into the proteome of Chelidonium majus latex (PDF abstract)

Joanna Gracz-Bernaciak1; Oliwia Mazur1; Natalia Kielich1; Michalina Krakowiak1; Sophia Bałdysz1; Martyna Węglewska1; Oskar Musidlak1; Agata Malinowska2; Robert Nawrot1

1Adam Mickiewicz University in Poznan, Faculty of Biology, Department of Molecular Virology, Poznan, Poland; 2Polish Academy of Sciences, Institute of Biochemistry and Biophysics, Mass Spectrometry Laboratory, Warsaw, Poland

MP 734: Quantitative spatial proteomics combined with lipidomic analysis of human hippocampus using laser capture microdissected cells from MALDI-imaged tissue sections (PDF abstract)

Lauren R. DeVine1; Caitlin M. Tressler1; Rahul A. Bharadwaj2; Kristine Glunde1; Daniel Weinberger2; Robert N. Cole1

1Johns Hopkins School of Medicine, Baltimore, MD; 2Lieber Institute for Brain Development, Baltimore, MD

TP 575: Automated Data Analysis Workflow Leveraging PASEF Data Accelerates Confident Detection of Low-Abundance HCPs (PDF abstract)

Amy Claydon1; Guillaume Tremintin2; Juergen Kastler3; Stuart Pengelley4; Jonathan Krieger2; Arnd Brandenburg3

1Genedata Ltd., Cambridge, United Kingdom; 2Bruker, San Jose, CA; 3Genedata AG, Basel, Switzerland; 4Bruker Daltonics, Bremen, Germany

Thumbnail from featured publication

Mascot培训资料

我们最近更新了Mascot的培训资料。增加了谱图库搜索和交连分析的两个新模块,同时更新了所有相关截图和每一页幻灯片。目前该版本的培训资料是以Mascot Server 2.7和Distiller 2.7为例来展示的,2.8版本的培训资料正在整理中。这些培训资料是免费提供的,适合自学或用于内部培训。

针对培训资料中的每个模块,我们也添加了其他相关内容的链接。比如,在最近的网站博文中,增加了很多深入的在线帮助文档和Youtube视频。随着相关内容的发布,我们会继续添加更多的链接。我们旨在为大家提供最全面的Mascot功能介绍资料。

5月到7月,我们将在今年夏天将把经典的培训课程视频上传到Youtube! 这些视频是以Mascot Server 2.5为基础,在为期两天的深度培训课程中录制的,尽管很多内容已经有点"过时"了,但仍与当前2.8版本密切相关。这些视频可以在我们的网站或者Youtube账号@matrixscience1998上观看。

Illustration of Mascot tip

About Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具,帮助他们更快速,更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

Matrix Science logo

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