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欢迎
我们很高兴能在最近于加利福尼亚州阿纳海姆举行的ASMS大会上见到大家，并想与大家分享我们在Matrix Science 用户会上介绍的一些新进展和信息。
会议上有许多出色的演讲，展示了Mascot在癌症蛋白质组学、生物标记物发现、定量蛋白质组学和生物制药等领域的应用。以下是我们汇总的一小部分内容。
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Mascot: 深受客户信赖25年的蛋白质质谱鉴定标准参考软件
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申请试用
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Matrix Science在ASMS 2024
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我们举办
了一场早餐会议，会上介绍了多项 Mascot 的新开发功能。新版 Mascot Server 的测试版即将发布。以下是一些令人期待的新功能。
机器学习：新版 Mascot 将整合 MS2Rescore，这是一款由根特大学 Lennart Martens 团队开发的模块化、用户友好的 AI 辅助肽段识别重评分平台。我们的目标是让您只需点击一个按钮，就能优化结果。为此，我们已将 DeepLC 和 MS2PIP 模型选项直接集成到Protein Family Summary报告的菜单控件中。
更快的容错搜索：目前，Mascot 的容错搜索会尝试 Unimod 中的每个修饰，而 Unimod 中有超过 2000 种修饰。然而，大多数情况下，您对样本中明确不存在的修饰有一个大致的了解。在新版中，您可以从容错搜索中排除特定的修饰类别，例如氨基酸替代、同位素标记和人工修饰。这将使搜索速度更快且更精确。
自定义 Distiller 报告：Mascot Distiller 2.8 提供了 14 种不同的报告，用于分析和导出您的定量结果，例如ANOVA方差分析、层次聚类、K-means 聚类、PCA主成分分析、火山图、表格导出等。只需具备一些 Python 和 Mascot Parser 库的知识，您就可以在 Distiller 中创建适用于新的应用场景和工作流程的自定义报告。
使用 Mascot Daemon 自动化操作：Mascot Daemon 可以在任务完成之前或之后自动运行操作。这些操作可在External Processes对话框中设置，但由于机制非常灵活，设置也较为复杂。因此，我们编写了一个名为 Mascot Daemon Export Extender 的封装程序，使得在任务结束时自动运行 Distiller 报告变得非常简单。
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ASMS上使用 Mascot 的精选报告
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以下是一些在 ASMS 大会上使用 Mascot 进行蛋白质鉴定、定量或表征的有趣报告。由于会议每天都有数百张海报，无法在此列出所有使用 Mascot 的报告。
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Chemical Proteomic Strategy Utilizing a Photoreactive Chloroalkane Capture Tag for Target Discovery (TP680)
Alba Katiria González Rivera, Robin Hurst, Sergiy Levin, Michael M. Rosenblatt, Rachel Friedman Ohana
采用具备足够的光交联和高度选择性富集能力的多功能氯化烷烃捕获标签，简化靶点解析策略。
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Identification of 15-keto-PGE 2 post-translational protein modifications by LC/MS/MS to study an anti-inflammatory therapy (TP720)
Fu-An Li, Ling-Hui Wang
我们的结果表明，通过服用 15-酮-PGE2，可以作为一种新的抗炎疗法来治疗饮食诱导的 NASH。
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Peptide Biomarkers in Human Breast Milk: Mass Spectrometry-Based In-Solution Proteomics Analysis for Early Detection and Treatment of Breast Cancer Development (WP066)
Victor Tochukwu Njoku, Danielle Whitham, Lilian Corrice, Brian T. Pentecost, Kathleen F. Arcaro, Costel C. Darie
验证了人类母乳中用于早期检测和治疗乳腺癌的特定潜在肽标志物。
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Acetylome analysis of aspirin treated AML cell lines using label-free LC-MS/MS reveals potentially cytostatic modifications in cytosolic and mitochondrial proteins (ThP139)
Luke Higgins, Tommy Shields, Vinothini Rajeeve, Pedro Rodriguez Cutillas
首次分析阿司匹林诱导的 AML 乙酰化组，揭示了阿司匹林对蛋白质乙酰化的新作用。
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Proteomic evaluation of tardigrades following ionizing radiation reveals increase in DNA repair pathways (ThP791)
Evan R Stair, Courtney Clark-Hatchel, Bob Goldstein, Leslie M. Hicks
揭示了水熊虫对电离辐射的耐受机制。
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About Matrix Science
Matrix Science为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助大家更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot每年被2000 多篇论文引用，软件全线支持来自Agilent, Bruker, Sciex, Shimadzu, Thermo Scientific和Waters质谱仪生成的质谱数据。
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请联系我们或我们的营销合作伙伴，了解如何利用 Mascot 推动蛋白质组学研究的更多信息。
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